DNA分析类软件

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DNA分析类软件

DNA分析软件，可寻找酶切位点，绘制质粒图谱、设计PCR引物、分子量计算、序列比对等等。http://www.stud.uni-karlsruhe.de/~uzbar/programs/mb661.exe

Java语言是一个跨操作平台的语言，用该语言编写的软件，可以跨操作平台使用，只要这个系统有支持Java语言的环境即可。在Windows环境下，IE与Netscape 浏览器均支持Java 语言，所以用 Java语言编写的分子生物学软件JaMBW便是在浏览器下工作的。JaMBW是一个分子生物学软件包，功能包括：序列格式转换、求序列的补体序列与逆序列、将DNA序列翻译成蛋白序列、序列分析、 多序列比较、特征位点查找、3维分子结构查看、PCR引物设计、缓冲液设计等功能，包含了分子生物学研究常用的一些操作。JaMBW是一个非常出色的工具软件。http://hometown.aol.com/lucatoldo/myhomepage/JaMBW.zip


一个非常方便的质粒绘制工具与DNA分析工具。它包括DNA序列输入与分析、限制酶消化分析以及环形与线性DNA图形输出等许多功能。作者将许多选择设计成选项，只须你选择即可，使用非常方便。软件需要的限制酶数据库。
http://hjem.get2net.dk/acaclone/download/pDRAW32setup.zip


DNA工具软件，对短DNA序列，它可进行补体序列生成、融合温度预测、GC百分含量计算、分子量计算、摩尔消光系数计算等功能。增加了许多功能，包括序列检索、注释、编辑，格式转换，限制酶分析、翻译、序列查找、反序与补序、序列统计、ORF查找、寡序列分析、探针分析等等，是一个有用而方便的小工具。
http://bioinformatics.org/annhyb/softwares/annhyb-4.922.zip


非常好用而且有名的DNA分析共享软件，含有部分蛋白序列分析功能。可以全功能使用90天。90天后仍然能够全功能使用，只是启动延时。
http://www.dnassist.org/dnassist.zip


确定蛋白家族新成员的基因序列，常常需要根据蛋白序列对比设计核苷酸序列。 DNAPROBE便是用来帮助在这种情况下进行核苷酸序列设计。
http://ftp.univie.ac.at/mirror/s ... cience/dnaprobe.zip


Artemis是a DNA sequence viewer and annotation tool的缩写，为一个免费的DNA序列查看器与注释工具，可以以图形形式查看序列的各种分析结果与特性。以Java写成，需要安装JRE1.2后(5.1M)，直接双击便可执行。程序读取EMBL与GENBANK格式的序列与纯DNA序列，为英国桑格中心推出。
http://www.sanger.ac.uk/Software/Artemis/v7/artemis_v7.jar